L'Istituto, sorto negli anni Cinquanta per iniziativa dell'ANPPIA (Associazione nazionale perseguitati politici antifascisti), si è costituito in Associazione il 12 aprile 1970 ad opera di significativi esponenti dell'intellettualità democratica pugliese, tra i quali Tommaso Fiore, Natale Lojacono, Fabrizio Canfora, Franco De Felice, Giuseppe Di Vagno.
Dal 1982 l'IPSAIC ha ottenuto il riconoscimento di archivio di notevole interesse storico dalla Soprintendenza archivistica della Puglia e dal 1988 è associato all'Istituto nazionale per la storia del movimento di Liberazione in Italia (INSMLI).
L'IPSAIC collabora all´attività di ricerca dell'INSMLI, del Ministero della pubblica istruzione, di diversi istituti universitari di Bari e di Foggia e svolge attivitì di consulenza per alcuni comuni pugliesi, tra cui il capoluogo, nel campo del recupero della memoria storica regionale e locale.
Collabora con programmi nazionali della RAI e partecipa a programmi di ricerca-didattica di diversi altri Enti culturali nazionali, tra cui l'ANIMI, e regionali, in particolare con la Biblioteca multimediale del Consiglio regionale della Puglia, con gli Archivi di Stato di Bari, di Foggia, di Brindisi, con la Biblioteca nazionale di Bari. Ha prodotto diversi volumi di documenti ed audiovisivi in collaborazione con l'Irsae Puglia, la Rai e il Consiglio regionale della Puglia.
Promuove la ricerca storica con convegni di studio, eventi culturali e con una biblioteca e un archivio specializzati. Assicura la comunicazione e la divulgazione critica dei risultati della ricerca e svolge attività di formazione e aggiornamento soprattutto nell´ambito delle comunità scolastica pugliese.

La biblioteca, in fase di riordino, conserva circa 8.000 tra volumi e opuscoli suddivisi in tre fondi distinti: "Enzo Mazzoccoli", "Vittore Fiore", dotazione originaria Anppia-IPSAIC. Il maggior numero di volumi tratta temi fondamentali della storia italiana del Novecento: lotte contadine e operaie del primo e secondo dopoguerra, fascismo, resistenza, storia dei partiti e dei sindacati, emigrazione e meridionalismo.

Oltre a materiale documentario vario non ordinato (lettere e diari di combattenti della prima guerra mondiale, memorie e lettere dal carcere e dal confino fascista, testimonianze sulla Resistenza in Puglia dopo l'8 settembre), il patrimonio archivistico consiste in 11 fondi inventariati: